PTMScanプロテオミクス：翻訳後修飾による改変を受けたペプチドの特定と定量
タンパク質の翻訳後修飾 (PTM) は、細胞増殖や発生、疾患など、生物学のさまざまな現象を制御しています。このようなPTMをプロテオミクス解析で解析することは、細胞内シグナル伝達に対する理解を深めるための主要な方法となっています。現行のプロテオミクス解析法や機器を使いて、一回の実験で何千ものペプチドを特定することができます。Cell Signaling TechnologyのPTMScanプロテオミクスは、抗体ベース濃縮と液体クロマトグラフィータンデム質量分析 (LC-MS/MS) を組み合わせ、翻訳後修飾による改変を受けたペプチドを同定し定量します。タンパク質のリン酸化、アセチル化、ユビキチン化、メチル化やスクシニル化、および細胞株、組織、異種移植片、またはその他生物学的材料からのカスパーゼ開裂 (PTMScan Discovery) の解析のための製品やサービスをご用意しています。重要なシグナル伝達経路の詳細な範囲を標的として設計されたサービスも提供しています (PTMScan Direct)。PTMScan法は、バイオマーカー発見、医薬品開発、および細胞シグナル伝達への理解を深めるための研究で使われ、成功を収めています。
Ubiquitin Remnant Immunoprecipitation (ユビキチンレムナント免疫沈降)、nLC-MS/MSおよび等圧タグ標識を用いた、Multiplexed Quantitative Ubiquitylome Analysis (マルチプレックス定量ユビキチローム解析)
近年、質量分析器や試薬が進歩したおかげで、大規模なマルチプレックス定量的プロテオミクス実験が行いやすくなっています。最近では、同重体タグ標識 (タンデム質量タグ) などを使い、10種類の実験サンプルから8,000を超えるタンパク質を、1.5日という解析期間で定量化することができるようになりました。しかし今までは、細胞ユビキチロームの解析は、1回の実験でマルチプレックス化できるサンプルの数に制約がありました。このウェビナーでは、PTMScan Ubiquitin Remnant Motif Antibody (Cell Signaling Technology) による免疫沈降と、この産物であるペプチドの等圧タグによる標識など、サンプル調製の方法を取り上げます。また細胞ユビキチロームを高い精度で解析する機器 (Synchronous Precursor Selection MS3、SPS-MS3など) についても科学者がお話します。さらにはチームがこの方法を応用し、Bortezomibによる処置後、10の定量化チャンネルにわたり、15,000を超えるユビキチン化部位に同時に発生する変化を定量化したことにも触れます。
解説者：
Matt P. Stokes博士
Proteomics Group主席科学者
Cell Signaling Technology, Inc.
Christopher Michael Rose
ポスドク研究員
ハーバード大学メディカル・スクールGygi Lab