Lab Expectations | CSTブログ

ビデオ:ChIP用の、酵素またはソニケーションによるクロマチン断片化

筆者:Kenneth Buck, PhD | Nov 6, 2019

クロマチンの断片化は、クロマチン免疫沈降 (ChIP) 実験の重要なプロセスであり、ChIPの成功を左右します。クロマチンの断片化にはソニケーション法と酵素消化法があります。それでは、どちらの手法がご自身の実験に適しているでしょうか?これには多くの要素が絡み合い、判断が難しいことが少なくありません。それでは、問題点をより簡単にしてしまいましょう。動画をご覧いただければ、その方法をご確認いただけます。

この動画では、4つの質問を通じて、皆様の実験のニーズに適したプロトコールと、理想的なCSTのChIPキットを見つけるお手伝いをします。

  1. 解析するサンプルは何ですか?細胞ですか?組織ですか?
  2. どのような種類のタンパク質がIPの標的となりますか?ヒストン、転写因子もしくはコファクターですか? 
  3. サンプル中に含まれる標的タンパク質の量は多いですか?少ないですか?
  4. よく行われるクロマチン断片化の方法は、酵素法ですか、それともソニケーション法ですか?

多くの場合、酵素法とソニケーション法のどちらかを使用することができますが、この動画では、一方の方法が他方よりも優れている場合がある例もご紹介します。

これらの質問が解決し、実験を開始する用意ができたら、下記をクリックしてオススメのChIPキットを探してください!

 

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