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タンパク質修飾O-GlcNAcを特定する抗体

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ラホーヤ免疫学研究所やブロード研究所、Cell Signaling Technology、およびイェール大学のRajan Burt氏、Samuel Myers氏、および同僚たちが、専門知識を結集し、普遍的なタンパク質の修飾であるO-GlcNAcylation (O-結合型N-アセチルグルコサミン化) を特定するための新しい道を切り開きました。この成果は、Molecular & Cellular Proteomicsに投稿した「Novel Antibodies for the Simple and Efficient Enrichment of Native O-GlcNAc Modified Peptides」と題する論文にて発表しました。

特異性が甘美になるとき

この歴史は古く、約40年前の1984年にTorres博士とHart博士によって単糖であるO-GlcNAcが同定されました。O-GlcNAcは、最も普遍的な翻訳後修飾 (PTM) の1つであり、核や細胞質、ミトコンドリアなど、細胞内のあらゆる区画に存在するタンパク質にみられます。細胞外環境に面して存在する非常に複雑なN-結合型糖鎖とは異なり、O-GlcNAcは単純な単糖で、転写のエピジェネティクス制御、ストレス応答、翻訳、タンパク質分解、恒常性維持など、ほとんどの複雑な生物学的経路に関与しています。

21-ETC-55250 O-GlcNAc_resized

O-GlcNAcは細胞の栄養レベルのセンサーとして機能するので、複数のシグナル伝達経路を統合する機能があります。特筆すべき点に、細胞全体のO-GlcNAc化は、セリン残基とスレオニン残基に単糖を付加するOGTと、PTMを酵素的に除去するOGAの、2つのタンパク質のみで制御されていることが挙げられます。より新しく、より全体論的なシグナル伝達モデルでは、単純な活性化と阻害の線形的なモデルが見直され、複数の経路や、複数のフィードバックやクロストークの状態を組み込んだモデルに移行しつつあります。これにより、糖尿病や神経変性、がんなどの一見多様なヒトの疾患に、あるPTMがどのように関与するかを部分的に説明することができます。

O-GlcNAcに特異的かつ感度の高いモノクローナル抗体

生物学や疾患におけるO-GlcNAcの役割を解明する上で、信頼性の高いPTMの同定は非常に重要になります。そこで、親タンパク質由来のO-GlcNAc化ペプチドを1度に免疫沈降できる、高感度で特異性の高いラビットモノクローナル抗体の混合物が、Cell Signaling Technologyの科学者によって作成されました。この抗体を利用したツールと、ブロード研究所の科学者による質量分析の進歩を組み合わせることで、1度の濃縮ステップで1,000以上のユニークなO-GlcNAc化部位を同定することが可能になりました。

PTMScan® O-GlcNAc [GlcNAc-S/T] Motif KitPTMScan® O-GlcNAc [GlcNAc-S/T] Motif Kitを用いて濃縮・同定した、トリプシンペプチドのモチーフ解析。10μM Thiamet-G (TMG) で6時間処理した10mgのHeLa細胞をトリプシンで消化し、PTMScan® O-GlcNAc [GlcNAc-S/T] Immunoaffinity Beadsで免疫沈降しました。Orbitrap Fusion Lumos質量分析計は、合計1,235のnon-redundant部位 (重複の無い配列) を同定しました。

さらに、このO-GlcNAc抗体は、エピマーであるO-GalNAcと比較してO-GlcNAcに強い優先傾向があることが示され、抗体の感度と特異性が裏付けられています。この技術は、天然のO-GlcNAc修飾ペプチドへの適用が容易で、in vivoサンプルや患者由来のサンプルのO-GlcNAcを解析できる可能性があります。

つまり、複雑で時間のかかる化学誘導体化を行うことなく、従来の1/10のサンプル量で、従来より質量分析にかかる時間を大きく短縮することができます。この研究によって、非常に特異的な試薬と革新的な質量分析の相乗効果による、探索研究の新たな道筋が示されました。

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Charles Farnsworth, PhD
Charles Farnsworth, PhD
Charles (Chuck) Farnsworth博士は、2024年に退職するまでの20年間、CSTのプロテオミクスアプリケーションサイエンティストとして務めました。博士は、PTMScan製品ラインの主任研究員であり、シニアプロテオミクスアプリケーションサイエンティストでもありました。また、Chuck博士は、タフツ大学で生化学を専攻し、ハーバード大学医学部で白血病リンパ腫協会の博士研究員として発生生物学とシグナル伝達を研究しました。退職後は、子供たちとのキャンプやバーモント州マッド・リバー・バレーでの星空観察など、好きなことに時間を費やしています。

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